MERMAID adalah aplikasi sumber terbuka yang mengumpulkan dan mengelola data kesehatan terumbu karang secara real-time, yang dikembangkan melalui kemitraan antara WCS, WWF, dan Sparkgeo.

Dengan MERMAID, para ilmuwan memasukkan hasil pengamatan mereka langsung ke dalam platform menggunakan aplikasi web. MERMAID melakukan pekerjaan menandai dan menyortir data, menghindari duplikasi, membakukan nama ilmiah, dan meringkas indikator-indikator penting.

Kami menghemat waktu Anda sehingga Anda dapat menyelamatkan terumbu karang!

MERMAID bergabung dengan Anda di lapangan dengan kemampuan off-line-nya, tetapi berbeda dari Excel atau aplikasi database pribadi seperti Access karena hampir tidak memerlukan pembersihan data pasca entri!

Pengguna dapat memilih nama ikan karang dan karang dari daftar taksa standar hanya dengan beberapa penekanan tombol; MERMAID akan melengkapi secara otomatis. Memilih nama berarti menghemat waktu untuk mengetikkan nama spesies atau membersihkan kesalahan pengetikan nama spesies yang salah eja.

MERMAID juga memungkinkan Anda menghitung biomassa ikan karang saat Anda mengetik, atau melihat tutupan karang total segera setelah Anda selesai memasukkan transek. Setelah Anda selesai mengumpulkan data, data tersebut dapat diekspor ke laporan lapangan standar (Excel) dan digunakan untuk membuat grafik atau laporan lainnya. Anda juga dapat menganalisis data Anda dengan mengaksesnya langsung dari MERMAID menggunakan mermaidr package.

Alur kerja MERMAID:

1. Daftar dan siapkan proyek

   1. Daftarkan sebuah akun

   2. Siapkan proyek dan tambahkan pengguna

   3. Persiapkan untuk penggunaan secara luring

2. Mengumpulkan data

   1. Pilih tipe transek

   2. Masukkan informasi situs

   3. Masukkan rezim manajemen

   4. Masukkan atribut bentik dan spesies ikan

   5. Lengkapi dan simpan transek

3. Tinjau dan kirimkan 

   1. Memvalidasi data

   2. Menindaklanjuti kesalahan dan peringatan

   3. Kirimkan data

4. Ekspor dan analisa data

   1. Ekspor data dalam format .XLSX untuk analisa lebih lanjut

   2. Analisa data langsung menggunakan mermaidr

   
   

Pertanyaan? Anda dapat menghubungi kami saat sedang daring melalui tautan Kontak di bagian bawah aplikasi. Versi luring (pdf) dari dokumentasi ini dapat diunduh melalui tombol "Unduh" pada menu bar disisi kiri.

Halaman Proyek

Halaman Proyek menyediakan ringkasan lengkap tentang apa yang terjadi di setiap proyek: jumlah unit sampel yang dikirim dan tidak dikirim, jumlah total situs dengan data, jumlah pengguna yang ditambahkan ke dalam proyek, dan bagaimana kebijakan pembagian data per protokol telah ditetapkan. Klik masing-masing untuk langsung menuju ke halaman proyek tertentu; sebagai contoh, Anda dapat mengakses halaman data yang dikirimkan proyek dengan mengklik Submitted. MERMAID Versi 2 juga menambahkan area notifikasi baru di menu ("lonceng") yang memberitahukan kepada Anda mengenai update terbaru dari MERMAID dan proyek-proyek Anda. Di dekat tombol notifikasi, Anda dapat menemukan tombol Reference yang dapat Anda akses dari halaman manapun. Sekarang, Anda dapat mengunduh Referensi dalam format XLSX dan memiliki semua data bentik dan ikan dalam satu dokumen. Setiap proyek juga menyertakan tombol Copy project dan Offline Ready dari MERMAID Versi 1.

Halaman Ikhtisar

Sebagai seorang manajer data, Anda mungkin ingin melihat sekilas semua data yang telah dikirimkan serta siapa yang harus dikejar untuk data yang belum dikirimkan. MERMAID Versi 2 memahami Anda. Sekarang terdapat halaman Overview yang memungkinkan Anda untuk memeriksa jumlah unit sampel yang telah dikirimkan per metode untuk setiap situs serta siapa yang belum mengirimkan unit sampel yang mana, dan memastikan bahwa situs-situs tersebut terkait dengan rezim manajemen yang tepat. Mengklik nomor unit sampel mana pun akan memberi Anda akses langsung ke unit sampel tersebut. Untuk melakukan perubahan, unit sampel harus dipindahkan dari halaman Submitted ke halaman Collecting. Validasi ulang diperlukan sebelum mengirimkan unit sampel yang telah diperbarui. Ini berarti tidak ada lagi perubahan situs yang tidak terduga atau kesalahan yang tidak diinginkan.

Halaman Collecting

Halaman Collecting yang baru dirancang untuk memungkinkan pengguna menangani peringatan dan kesalahan dengan lebih mudah. Halaman ini juga menampilkan pemberitahuan mengapa unit sampel tidak dapat dikirimkan, untuk membantu Anda mengatasi masalah dengan lebih cepat. Pesan lebih mudah dipahami dan muncul di sebelah bidang yang bermasalah. MERMAID Versi 2 juga menangani duplikasi situs dan rezim manajemen dengan cara yang lebih cerdas; Versi 1 akan memeriksa duplikasi setiap kali situs atau rezim manajemen disimpan, sedangkan dalam Versi 2, duplikasi hanya diperiksa ketika validasi unit sampel, dan hanya terhadap unit sampel yang telah dikirimkan -- proses yang lebih efisien dan relevan. Metode photo transect sekarang tersedia di MERMAID Versi 2 untuk menyimpan photo hasil klasifikasi. Pada halaman Submitted, tombol Export to XSLX sekarang menghasilkan satu file dengan data yang diagregasi ke unit sampel dan tingkat kejadian sampel serta pengamatan mentah.

Halaman Users

Halaman Users yang baru menyediakan informasi yang lebih rinci tentang pengguna dalam proyek, untuk tim dengan berbagai ukuran. MERMAID Versi 2 mendukung penyaringan pengguna berdasarkan nama atau alamat email. Admin juga dapat mengubah peran, menambah dan menghapus pengguna tanpa harus membuka halaman lain, dan mengakses alamat email pengguna untuk memudahkan kontak.

Lihat pengumuman MERMAID Versi 2. Jika Anda memiliki pertanyaan atau ingin mengetahui lebih lanjut tentang MERMAID Versi 2, hubungi kami.

Klik 'Reference' pada toolbar utama (kanan atas aplikasi MERMAID Collect) untuk mengunduh file xlsx berisi semua atribut bentik dan spesies / genus / famili ikan yang digunakan di MERMAID. File xlsx ini dapat diunduh secara luring maupun daring.

Di dalam file xlsx, Anda akan menemukan lima lembar: Famili Ikan, Genera Ikan, Spesies Ikan, Pengelompokan Ikan, dan Bentik. Setiap lembar memberikan informasi untuk tingkat taksonomi tersebut. Dengan menggunakan filter, Anda dapat mencari dan menyortir informasi spesifik yang Anda cari.

Atribut ikan dan bentik di MERMAID telah distandardisasi, dan diselaraskan dengan nama-nama yang diterima di World Register of Marine Species (WORMS), sehingga tidak ada lagi perbedaan antara data yang dimiliki oleh pengguna yang berbeda. Namun, jika Anda ingin mencatat pengamatan tentang sesuatu yang menurut Anda belum ada, Anda dapat mengusulkan untuk menambahkannya di aplikasi, dan akan ditinjau oleh tim MERMAID. Sebelum menambahkan spesies ikan atau bentik baru, pastikan Anda menggunakan nama ilmiah yang telah diterima oleh WORMS.

Setelah Anda mengusulkan spesies ikan atau atribut bentik baru, Anda dapat langsung menggunakannya saat memasukkan data. Tim MERMAID akan menerima usulan Anda dan membuatnya tersedia untuk semua pengguna MERMAID lainnya, atau bekerja sama dengan Anda untuk menormalisasikan spesies atau atribut yang diusulkan dengan spesies atau atribut yang sudah ada; bagaimanapun juga, kami akan memberitahu Anda melalui email.

Mengusulkan spesies ikan baru

1. Di transek sabuk ikan mana pun, gulir ke bawah ke tabel Pengamatan.

2. Ketikkan spesies ikan yang ingin Anda tambahkan. Jika apa yang Anda ketik tidak sesuai dengan spesies ikan yang ada di MERMAID, pilihan untuk mengusulkan spesies baru akan muncul.

3. Klik pilihan "Propose New Species"

4. Ketikkan nama genus pada kolom Genus. Jika genus yang Anda cari tidak ada ("No results found"), kirimkan email kepada kami dengan mengklik tombol "Contact" di bagian kanan bawah aplikasi.

5. Ketikkan nama spesies pada kolom Spesies dan klik "Next".

6. Klik "Send to MERMAID for review" untuk melengkapi usulan Anda.

Mengusulkan atribut bentik baru

1. Dalam transek bentik mana pun, gulir ke bawah ke tabel Pengamatan

2. Ketikkan atribut bentik yang ingin Anda tambahkan. Jika apa yang Anda ketik tidak sesuai dengan atribut bentik yang ada di database kami, pilihan untuk mengusulkan atribut bentik baru akan muncul.

3. Klik pilihan "Propose New Benthic Attribute"

4. Ketikkan nama induk pada kolom Parent. Biasanya, "Induk" adalah genus atau famili karang, tetapi dapat berupa atribut non-trofik. Sebagai contoh, untuk menambahkan spesies Acropora baru bernama Acropora test, ketik/pilih Acropora di bidang Parent, kemudian ketik Acropora test di bidang Name, dan klik "Next".

5. Klik "Send to MERMAID for review" untuk menyelesaikan proposal Anda.

Hierarki taksonomi standar

MERMAID telah mengembangkan satu set hirarki taksonomi standar untuk pengamatan ikan karang dan bentik yang digunakan bersama di seluruh aplikasi MERMAID Collect, Dashboard, dan R Package. Hal ini menghilangkan pembersihan data yang panjang, menyederhanakan analisis, dan memudahkan untuk membuat bagan dan laporan yang dapat direproduksi dari data Anda.

Pengamatan ikan karang dikumpulkan dari spesies ke genus ke famili ke kelompok trofik (misalnya herbivora, planktivora, dll.).

Pengamatan bentik dikumpulkan dari spesies ke genera ke famili ke kategori bentik tingkat atas (misalnya karang keras, karang lunak, makroalga).

Pengamatan ikan karang

Untuk pengamatan ikan karang, konstanta biomassa, panjang maksimum, tingkat trofik, kerentanan penangkapan ikan, skor iklim, dan distribusi geografis diambil dari FishBase;

• Karena nilai referensi konstanta biomassa dan tingkat trofik disediakan oleh spesies di FishBase, ketika menggunakan pengamatan ikan tingkat genus atau famili di Collect, MERMAID secara otomatis akan menghitung rata-rata nilai tingkat spesies. Sebagai contoh, dengan mengetikkan "Acanth'', Anda dapat merekam pengamatan untuk famili "Acanthuridae", genus "Acanthurus", atau spesies "Acanthurus achilles"; jika Anda memilih "Acanthurus", maka nilai konstanta biomassa adalah rata-rata dari semua spesies dalam genus "Acanthurus".

Pengamatan bentik

MERMAID menggunakan taksonomi hirarkis untuk atribut bentik. Ini berarti bahwa setiap atribut dapat 'digulung' ke dalam salah satu dari 12 kategori bentik tingkat atas yang tersedia dalam unduhan data xlsx dari MERMAID dan ditampilkan di dasbor MERMAID.

Ke-12 kategori tingkat teratas adalah:

• Substrat kosong (misalnya, batu)

• Alga koralin berkerak

• Sianobakteri

• Karang keras

• Makroalga

• Lainnya (mis, sampah, plastik, dll)

• Invertebrata lain

• Pecahan karang

• Pasir (termasuk lumpur)

• Lamun

• Karang lunak

• Turf algae (termasuk karang mati atau karang mati dengan algae)

Misalnya, 'Acropora palmata' bergulir ke 'Acropora' kemudian 'Acroporidae' kemudian kategori tingkat atas terakhir 'Karang keras'. Klasifikasi kategori tingkat atas disediakan sebagai kolom terpisah dalam unduhan xlsx dari data MERMAID yang Anda kirimkan.

• Analisis khusus, seperti menghitung persentase untuk atribut bentik yang bukan merupakan kategori tingkat atas, dapat dilakukan dengan menggunakan data tingkat pengamatan dengan mengekspor data yang dikirimkan dari proyek atau mengakses secara langsung dengan menggunakan paket mermaidr.

Menggunakan filter 'kosong' pada kolom Parent dari file Reference xlsx akan memberi Anda daftar 12 kategori tingkat atas.

Memfilter atribut bentik tertentu di kolom "Parent" akan menampilkan semua atribut bentik yang menjadi miliknya.

Setelah data Anda disimpan, data tersebut dapat divalidasi. Validasi adalah "pengoreksian" informasi unit sampel dan pengamatan. Di sinilah kesalahan dan pencilan akan tertangkap dan menjadi perhatian Anda untuk diperbaiki. Validasi situs dan rezim manajemen diperiksa hanya terhadap unit sampel yang telah dikirim. Pemberitahuan kenapa unit sampel tidak bisa dikirimkan tertulis dibawah tombol Submit untuk membantu Anda menindaklanjuti isu dengan lebih cepat.

Validasi hanya dapat dilakukan secara daring.

Setelah menyimpan transek, klik tombol "Validate" berwarna merah yang telah diaktifkan untuk memvalidasi transek Anda.

Setelah berhasil memvalidasi transek dan memperbaiki kesalahan atau peringatan, tombol Validate akan berwarna abu-abu dan tombol Submit akan diaktifkan dengan warna merah.

Setelah melakukan validasi, Anda akan menerima salah satu dari hasil berikut:

A. Sukses!

Kerja bagus, unit sampel Anda berhasil divalidasi! Tidak ada kesalahan pada data dan data siap dikirim.

B. Peringatan

Sebuah peringatan berwarna kuning akan muncul di bagian atas halaman atau pada kolom formulir individual jika MERMAID mengidentifikasi potensi masalah pada informasi transek Anda. Peringatan adalah validasi yang mengidentifikasi data yang dimasukkan yang mungkin, tetapi tidak biasa.

Anda dapat memutuskan apakah setiap peringatan dapat diabaikan dengan aman untuk data Anda. Jika masalah yang terjadi adalah kesalahan entri data, Anda dapat memperbaiki data di kolom tersebut, atau pada beberapa kasus dengan mengklik tombol "Resolve" untuk membuka dialog di mana Anda dapat menambahkan atau mengubah informasi. Klik "update" untuk memasukkan perubahan Anda ke dalam transek. Anda juga dapat menavigasi ke kolom yang memiliki masalah dengan mengklik "Scroll to observations" di sebelah peringatan.

Setelah menindaklanjuti peringatan, simpan kembali transek dan validasi kembali. Ulangi proses ini untuk setiap peringatan tambahan yang teridentifikasi. Jika Anda tidak yakin bahwa peringatan tersebut akurat untuk transek Anda, Anda dapat mengabaikannya dengan mengklik kotak centang 'Ignore warning' di sebelah peringatan tersebut.

C. Kesalahan

Pesan peringatan berwarna merah akan muncul jika MERMAID mengidentifikasi adanya kesalahan dalam informasi atau pengamatan unit sampel. Kesalahan harus diperbaiki sebelum transek dapat dikirimkan; kesalahan tidak dapat diabaikan. Untuk mengatasi setiap kesalahan, gulir ke bawah ke kolom yang memiliki pemberitahuan 'ERROR' dan langsung ubah informasinya.

Setelah memperbaiki semua kesalahan, simpan transek dan validasi kembali. Ulangi proses ini untuk setiap kesalahan tambahan yang teridentifikasi, sampai semua pemberitahuan 'ERROR' hilang.

D. Kirim data

Setelah Anda selesai memasukkan data untuk unit sampel dan telah memperbaiki semua Kesalahan dan Peringatan, Anda dapat mengirimkan unit sampel.

Setelah mengirimkan data, pengguna admin masih dapat mengedit transek atau mengembalikan transek kepada pengamat, jadi sebagai kolektor, pastikan data Anda sudah final dan bersih sebelum mengirimkannya! Pengiriman data hanya dapat dilakukan saat daring.

Untuk mengirimkan data, pilih tombol merah pada transek yang telah divalidasi yang bertuliskan "Submit".

Mengirimkan data akan memindahkannya dari halaman "Collecting" ke halaman "Submitted". Hal ini akan membagikan pengamatan Anda dengan pengguna lain dalam proyek yang sama (dan tergantung pada pengaturan Pembagian Data, mungkin juga dengan dunia). Di dalam halaman "Submitted", admin dapat mengedit atau menghapus transek atau mengembalikannya ke pengamat aslinya untuk diedit lebih lanjut.

Jika Anda adalah anggota read-only pada sebuah proyek, Anda dapat melihat data setelah data tersebut dikirimkan dan Anda dapat mengekspornya, tetapi Anda tidak dapat mengedit data tersebut ketika berada di MERMAID.

Anda juga dapat melihat data yang dikirimkan per proyek di dasbor MERMAID langsung dari aplikasi Collect. Cukup dengan mengklik ikon 'View on Dashboard' disamping nama proyek untuk navigasi ke dasbor.

Area OVERVIEW menyediakan tampilan tingkat proyek tentang bagaimana kemajuan proyek dan cara mudah untuk mengetahui siapa yang harus dikejar untuk data yang hilang. Area ini juga ditingkatkan dengan fitur penyaringan berdasarkan metode melalui tombol di sebelah bilah pencarian. Fitur ini memungkinkan pengguna untuk menyaring dengan berbagai cara. Total unit sampel yang menggunakan metode yang dipilih akan ditampilkan disamping tombol filter.

Halaman 'Observers and Transects' merangkum jumlah transek yang telah dikirimkan dan yang belum dikirimkan per lokasi dan metode. Arahkan kursor ke setiap nomor transek untuk melihat informasi rinci termasuk siapa orang terakhir yang mengedit transek, siapa pengamat yang mengumpulkan transek, nama lokasi, rezim manajemen, dan tanggal pengumpulan. Anda juga dapat membuka transek yang telah dikirimkan dengan mengklik 'View Submitted Sample Unit'.

'Management Regimes Overview' merangkum jumlah unit sampel yang dikirimkan (bukan yang tidak dikirimkan) per rezim manajemen. Rezim manajemen yang tidak memiliki transek yang dikirimkan tidak akan muncul di tabel 'Management Regimes Overview'. Anda dapat mengklik nomor transek untuk melompat ke informasi unit sampel yang dikirimkan.

Jika Anda baru mengenal MERMAID tetapi memiliki data dari survei sebelumnya dalam format lain, Anda mungkin mencoba mencari cara untuk mengimpor data lama Anda ke dalam MERMAID. Paket mermaidr adalah cara untuk memasukkan data lama Anda ke dalam MERMAID.

Memasukkan data menggunakan paket mermaidr sebaiknya hanya digunakan untuk data lama. Untuk proyek yang sedang berjalan, akan lebih mudah untuk menggunakan aplikasi secara langsung.

Langkah-langkah untuk memasukkan data menggunakan paket mermaidr:

1. Membuat sebuah proyek di MERMAID dengan situs, rezim manajemen, dan pengguna yang telah ditambahkan.

2. Menyesuaikan format data Anda dengan templat MERMAID. Anda dapat mengunduh templat untuk setiap metode dengan menggunakan fungsi mermaid_import_get_template_and_options dari paket mermaidr. Informasi lebih lanjut mengenai cara menggunakannya dapat dilihat disini.

3. Pastikan kolom-kolom yang wajib diisi sudah terisi. Kolom yang wajib diisi ditandai dengan tanda bintang (*) pada nama kolom.

4. Periksa setiap kolom untuk memastikan bahwa kolom tersebut sesuai dengan opsi kolom yang diterima untuk mengimpor data untuk metode tertentu. Untuk memeriksa setiap bidang, gunakan fungsi mermaid_import_check_options dari paket mermaidr. Informasi lebih lanjut dan contoh bagaimana cara menggunakannya dapat dilihat disini. Kolom yang sesuai akan menghasilkan tanda centang hijau.

5. Setelah semua kolom melewati proses pengecekan, Anda dapat mengimpor data Anda dengan menggunakan fungsi mermaid_import_project_data dari paket mermaidr. Informasi lengkap dan contohnya dapat dilihat disini.

Semua data yang dimasukkan akan muncul di halaman Collecting. Data-data ini harus melalui proses validasi dan pengiriman reguler. Untuk contoh cara memasukkan data lama Anda menggunakan paket mermaidr, buka contoh memasukkan data sabuk ikan.

Transek yang sudah dimasukkan ke MERMAID namun belum dikirim akan muncul di halaman Collecting dari pengguna yang memasukkan transek menggunakan paket mermaidr. Untuk mentransfer unit sampel yang belum dikirim ke pengguna lain, admin proyek dapat menggunakan halaman Users di proyek yang sama.

Kami juga telah menyiapkan video di bawah ini untuk memandu Anda melalui langkah-langkah memasukkan transek menggunakan paket mermaidr, dengan menggunakan data historis sabuk ikan sebagai contoh.